15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0970 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0970  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.431239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1716  hypothetical protein  63.48 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7565  hypothetical protein  46.33 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2489  hypothetical protein  43.53 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.0767999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6246  hypothetical protein  39.02 
 
 		 512 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2077  hypothetical protein  40.09 
 
 		 528 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0447  hypothetical protein  33.77 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2934  hypothetical protein  33.18 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0647  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0913041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3535  hypothetical protein  33.19 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0309  hypothetical protein  36.32 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.858216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3780  hypothetical protein  30.83 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0486  hypothetical protein  31.96 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0407  hypothetical protein  31.65 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.62 
 
 		 520 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>