19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0817 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0817  putative CoxF  100 
 
 		 53 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  85.11 
 
 		 55 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  71.15 
 
 		 54 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  71.15 
 
 		 54 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  73.08 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  73.08 
 
 		 56 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  73.08 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4585  putative CoxF  96.23 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0831  protein CoxF  74.07 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  0.245845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  50.91 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  59.09 
 
 		 54 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  59.09 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  54.55 
 
 		 50 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  54.55 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  54.55 
 
 		 54 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  54.55 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  58.82 
 
 		 46 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  58.82 
 
 		 46 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  58.82 
 
 		 45 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>