10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0009 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0009  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1133  hypothetical protein  65.77 
 
 		 149 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3807  hypothetical protein  65.1 
 
 		 149 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3634  hypothetical protein  63.51 
 
 		 149 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3319  hypothetical protein  63.76 
 
 		 149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3431  hypothetical protein  65.77 
 
 		 149 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5371  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3322  hypothetical protein  48.15 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2357  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2695  hypothetical protein  51.85 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>