32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4353 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4353  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107757  normal  0.0188618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2350  hypothetical protein  78.38 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1215  hypothetical protein  78.38 
 
 		 75 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1089  hypothetical protein  78.38 
 
 		 75 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.614221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2591  hypothetical protein  75.68 
 
 		 84 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1233  hypothetical protein  75.68 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1374  hypothetical protein  58.33 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0400  hypothetical protein  54.17 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0409  hypothetical protein  54.17 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0518  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0710  hypothetical protein  58.21 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0933302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0459  hypothetical protein  51.39 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.555176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2754  hypothetical protein  52.78 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0944  hypothetical protein  51.39 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5346  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4374  hypothetical protein  51.39 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0524  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248456  normal  0.33753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3426  hypothetical protein  48.61 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0568  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3107  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3300  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561941  normal  0.761211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0723  hypothetical protein  45.31 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.549756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3935  hypothetical protein  49.3 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1114  hypothetical protein  54.17 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2030  hypothetical protein  44.29 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.979837  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3741  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.6246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3071  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0749  hypothetical protein  36.76 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2405  hypothetical protein  36.76 
 
 		 71 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.368426  normal  0.694477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2951  hypothetical protein  41.79 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.361374  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2183  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0488  hypothetical protein  40.82 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>