13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1782 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  68.93 
 
 		 323 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3512  hypothetical protein  69.58 
 
 		 323 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652436  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  67.1 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  62.66 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  61.49 
 
 		 320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  58.6 
 
 		 321 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  27.71 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  37.8 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  35.06 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>