13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3463 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  76.19 
 
 		 65 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  64.52 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  62.3 
 
 		 70 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  62.3 
 
 		 70 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3163  hypothetical protein  52.54 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  41.54 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  50.91 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0914  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1641  hypothetical protein  41.94 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1067  hypothetical protein  36.84 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.126814 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1139  hypothetical protein  47.83 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>