54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3351 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  83.57 
 
 		 207 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  78.37 
 
 		 208 aa  340  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  65.52 
 
 		 208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  67.5 
 
 		 205 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  67 
 
 		 205 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  66.83 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  61.58 
 
 		 205 aa  272  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  59.9 
 
 		 205 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  55.39 
 
 		 205 aa  224  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  51.03 
 
 		 443 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  48.02 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  49.5 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  49.01 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  49.01 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  49.01 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  49.01 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  48.51 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  48.51 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  54.45 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  46.7 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  46.43 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  43.59 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  43 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  38.42 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  39.15 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  38.86 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  34.62 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  37.24 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  31.16 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  30.14 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  30.1 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  30.57 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  33.07 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 380 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  33.07 
 
 		 378 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  33.07 
 
 		 378 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 380 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  33.07 
 
 		 378 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 380 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  30.43 
 
 		 305 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>