61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4353 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  93.53 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  66.33 
 
 		 201 aa  278  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  63 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  63 
 
 		 201 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  63 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  61.5 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  59.11 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  55.34 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  55.84 
 
 		 207 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  49.26 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  29.17 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.47 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.82 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  25.48 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  32.16 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  30.41 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  31.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  27.95 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  26.14 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  31.4 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  31.4 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  27.67 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  31.21 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  30.67 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  25.48 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  25.48 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.66 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  30.49 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  30.49 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  30.3 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  25.66 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  30.26 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.17 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  30.92 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  30.43 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  29.14 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  30.52 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  26.32 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2345  hypothetical protein  27.59 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004218  LPS-assembly lipoprotein RlpB precursor  28.93 
 
 		 179 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00101724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  27.03 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  25.17 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  24.5 
 
 		 172 aa  45.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.38 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.38 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01221  hypothetical protein  29.56 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.38 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0477  rare lipoprotein B  25.25 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.421577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.39 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  29.27 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  27.7 
 
 		 164 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  24.66 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0575  hypothetical protein  25.9 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000903438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>