14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1911 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  202  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  94.9 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  65.31 
 
 		 99 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1705  type IV pilus assembly PilZ  62.24 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  62.24 
 
 		 99 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  62.24 
 
 		 99 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  57.14 
 
 		 99 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  43.62 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  42.55 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  37.23 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  39 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1284  type IV pilus assembly PilZ  40.85 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.825069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  24.47 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  26.8 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>