20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0369 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  100 
 
 		 84 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  96.43 
 
 		 84 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  84.52 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  77.11 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  75.9 
 
 		 85 aa  137  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  80.82 
 
 		 84 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  79.45 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  79.45 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  79.45 
 
 		 84 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  67.06 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  71.21 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  40.24 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  47.06 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  41.25 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  42.86 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  35.9 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 196 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 196 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 184 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>