24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0115 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  91.15 
 
 		 226 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  70.08 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  55.91 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  55.51 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  55.25 
 
 		 254 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  38.31 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  32.55 
 
 		 250 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  38.27 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  32.88 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  30.24 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  26.72 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  31.42 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  30.09 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  29.03 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  30.48 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  23.65 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  39.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  39.34 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  39.34 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  39.34 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  39.34 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  39.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  39.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>