12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1919 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1090    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.478195  hitchhiker  0.00137011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2210  FAD dependent oxidoreductase  94.47 
 
 		 535 aa  1039    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0334587 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1895  FAD dependent oxidoreductase  52.94 
 
 		 579 aa  552  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0260  hypothetical protein  46.65 
 
 		 495 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1577  FAD dependent oxidoreductase  47.52 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.443791  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05798  oxidoreductase  45.86 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1411  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 490 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3907  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134239  normal  0.273927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000165  hypothetical protein  46.01 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303978  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0719  hypothetical protein  45.25 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000137883  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0595  putative exported oxidoreductase  41.3 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05208  hypothetical protein  23.02 
 
 		 311 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0185066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>