19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1771 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1771  cell division protein ZapA  100 
 
 		 148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0377229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2053  hypothetical protein  86.27 
 
 		 152 aa  260  4e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.411502 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1880  hypothetical protein  55.56 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  30.68 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  30.59 
 
 		 99 aa  47.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  29.21 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  27.47 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  27.27 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  26.14 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  26.97 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  26.14 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  25.84 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  26.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  26.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  26.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>