14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2294 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2046  hypothetical protein  39.77 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2349  hypothetical protein  39.77 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000863109  normal  0.0220704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  35.48 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  32.61 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  31.75 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  30.77 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  38.24 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  37.7 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  31.18 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  29.21 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  26.37 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  26.37 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>