12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1895 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1895  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 579 aa  1204    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2210  FAD dependent oxidoreductase  53.72 
 
 		 535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0334587 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1919  hypothetical protein  53.35 
 
 		 524 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.478195  hitchhiker  0.00137011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0260  hypothetical protein  42.57 
 
 		 495 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1577  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 491 aa  415  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.443791  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3907  FAD dependent oxidoreductase  42.64 
 
 		 491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.134239  normal  0.273927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05798  oxidoreductase  40.89 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1411  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0719  hypothetical protein  40.19 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000137883  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000165  hypothetical protein  39.5 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0595  putative exported oxidoreductase  39.7 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05208  hypothetical protein  26.76 
 
 		 311 aa  94  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137402  normal  0.0185066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>