16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1169 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  239  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  56.78 
 
 
132 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  52.54 
 
 
132 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  42.37 
 
 
125 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  39.83 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  37.29 
 
 
130 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  37.29 
 
 
131 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  37.29 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  38.14 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  38.14 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  37.29 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  36.52 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  37.29 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  34.18 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  29.49 
 
 
189 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  34.18 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>