10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3362 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3362  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1303    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.621947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4098  hypothetical protein  92.09 
 
 		 645 aa  1204    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0124  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.97 
 
 		 431 aa  135  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.722928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0933  hypothetical protein  28.87 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3689  hypothetical protein  28.97 
 
 		 562 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.64 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3857  hypothetical protein  25.97 
 
 		 750 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0204  hypothetical protein  29.19 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2080  hypothetical protein  23.21 
 
 		 664 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313758  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2744  hypothetical protein  28.92 
 
 		 713 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>