19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3192 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  99.21 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  55.91 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  51.97 
 
 		 258 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  54.33 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  42.04 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  32.93 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  39.06 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  37.18 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  34.21 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  28.94 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  31.9 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  29.09 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  33.48 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  28.11 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  27.42 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  29.13 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  29.13 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>