10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1371 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4468  hypothetical protein  51.16 
 
 		 625 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  30.97 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0950  hypothetical protein  37.33 
 
 		 633 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0249813 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  32.04 
 
 		 345 aa  46.6  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  27.61 
 
 		 154 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  26.23 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2098  tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein  27.93 
 
 		 653 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  35.14 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2298  tetratricopeptide TPR_2  28.3 
 
 		 664 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>