84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1326 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4563  RNA binding S1 domain protein  99.28 
 
 		 278 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1326  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4071  RNA-binding S1 domain-containing protein  98.92 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3864  RNA-binding S1 domain-containing protein  92.09 
 
 		 278 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1446  RNA binding S1  75.36 
 
 		 278 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3786  RNA binding S1  75 
 
 		 278 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198165  normal  0.0264698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1593  hypothetical protein  74.64 
 
 		 278 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3187  GntR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 280 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.0826379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16900  RNA binding protein, S1 family  67.27 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4253  hypothetical protein  69.2 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49930  hypothetical protein  69.93 
 
 		 279 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.358542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1452  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.45 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1966  hypothetical protein  50.55 
 
 		 276 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294395  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1724  hypothetical protein  49.28 
 
 		 301 aa  267  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.437519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1623  hypothetical protein  49.08 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003424  hypothetical protein  46.24 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303245  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1111  hypothetical protein  47.67 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1555  hypothetical protein  48.72 
 
 		 279 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1630  hypothetical protein  48.35 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0406608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1868  hypothetical protein  47.99 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02354  hypothetical protein  45.88 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2281  hypothetical protein  45.68 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.014395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4487  hypothetical protein  46.18 
 
 		 284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.830856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2031  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.62 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1759  hypothetical protein  46.89 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2519  hypothetical protein  46.89 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.830114 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1803  hypothetical protein  46.89 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1645  hypothetical protein  46.89 
 
 		 280 aa  248  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1766  hypothetical protein  46.89 
 
 		 280 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.530453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1618  hypothetical protein  46.55 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  normal  0.0266154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2056  hypothetical protein  47.27 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00868426  normal  0.106459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4023  hypothetical protein  46.55 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1518  hypothetical protein  46.52 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0135842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2610  hypothetical protein  46.55 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2481  hypothetical protein  43.53 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0367564  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1514  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.19 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1697  hypothetical protein  44.73 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1813  hypothetical protein  41.45 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0500461  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5129  RNA binding S1 domain protein  41.45 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1813  hypothetical protein  41.94 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1515  nucleic acid binding protein  43.27 
 
 		 276 aa  219  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4021  hypothetical protein  42.39 
 
 		 276 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2080  RNA binding S1 domain protein  42.55 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56309e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2136  RNA binding S1 domain protein  42.55 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2783  hypothetical protein  39.15 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0117976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2473  RNA binding S1 domain protein  41.67 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.728532 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11108  hypothetical protein  38.55 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3240  uncharacterized protein-like protein  41.88 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1727  yitL protein  37.08 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2579  RNA binding S1 domain protein  39.26 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.401264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0626  hypothetical protein  36.53 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01079  hypothetical protein  37.24 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0235  hypothetical protein  38.69 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000105707  hitchhiker  0.0000000000000116702 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0312  hypothetical protein  33.82 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1902  hypothetical protein  39.41 
 
 		 280 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1621  hypothetical protein  38.66 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2647  hypothetical protein  37.17 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.902029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0250  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0056  RNA binding S1  39.25 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2903  RNA binding S1 domain protein  35.13 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144767  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0712  RNA binding S1 domain protein  29.71 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000721227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1274  hypothetical protein  28.41 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1319  hypothetical protein  28.41 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1187  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1214  hypothetical protein  28.41 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4127  hypothetical protein  28.41 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.098552  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1065  hypothetical protein  28.04 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1060  hypothetical protein  28.04 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1167  hypothetical protein  28.04 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1241  hypothetical protein  28.04 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1082  hypothetical protein  28.04 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0877  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.11 
 
 		 284 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0886  RNA binding S1 domain protein  27.63 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000369657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1062  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.68 
 
 		 284 aa  92.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2289  RNA-binding protein  29.14 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0961  hypothetical protein  24.2 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.93034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1481  hypothetical protein  25.86 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0476  RNA-binding protein  29.29 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1452  hypothetical protein  25.86 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0752  hypothetical protein  27.19 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000115591  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0883  RNA-binding protein  28.21 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000841553 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1511  hypothetical protein  28.33 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1301  RNA-binding protein  27.54 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.237432  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42428  predicted protein  35.24 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>