31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1317 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  94.68 
 
 		 357 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  98.6 
 
 		 357 aa  718    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  725    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  90.2 
 
 		 357 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  74.79 
 
 		 358 aa  559  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  73.71 
 
 		 355 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  72.93 
 
 		 356 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  71.59 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  69.83 
 
 		 361 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  64.53 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  43.2 
 
 		 357 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  42.73 
 
 		 379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  37.68 
 
 		 395 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  30.95 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  31.59 
 
 		 393 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  30.4 
 
 		 401 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  30.15 
 
 		 413 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  28.45 
 
 		 376 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  27.3 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  25.41 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  33.9 
 
 		 541 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  33.9 
 
 		 541 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  26.63 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  26.63 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  24.93 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  23.49 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1098 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  25 
 
 		 996 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  19.72 
 
 		 1124 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  23.56 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  20.7 
 
 		 981 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>