10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4933 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4933  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  191  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000154034  hitchhiker  0.0000000705895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0693  hypothetical protein  60.47 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000477278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0691  hypothetical protein  60.47 
 
 
89 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000978963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0223  hypothetical protein  59.76 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4876  hypothetical protein  48.78 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770869  normal  0.193901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2026  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.762179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  34.62 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  34.65 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4388  hypothetical protein  47.27 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  33.66 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>