22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4528 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  37.64 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  34.62 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  34.27 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  33.9 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  35.14 
 
 		 191 aa  98.2  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  33.53 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  33.14 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  30.86 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  34.08 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  29.44 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  32.78 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  33.52 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  32.62 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  28.18 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  26.9 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  25.99 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  26.47 
 
 		 793 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  43.75 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>