15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3453 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  100 
 
 		 1527 aa  3113    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1571 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1559 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1555 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1530 aa  155  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1565 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1586 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1586 aa  127  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1743 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1742 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  31.62 
 
 		 859 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4544  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1844 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2566  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1609 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812581 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1830 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0503  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1044 aa  45.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.778567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>