11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0565 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  89.33 
 
 
150 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  87.42 
 
 
158 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  83.33 
 
 
194 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  67.39 
 
 
154 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  58.67 
 
 
149 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  61.48 
 
 
149 aa  152  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  55.71 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  58.93 
 
 
152 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  47.96 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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