14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0405 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1571 aa  762    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  33.82 
 
 		 1530 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  46.53 
 
 		 1559 aa  1278    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  100 
 
 		 1555 aa  3147    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1565 aa  599  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  30 
 
 		 1586 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1586 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1527 aa  158  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1743 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1742 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  34.07 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1830 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0413  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1074 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2566  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1609 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>