20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5360 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  98.39 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  95.16 
 
 		 124 aa  243  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  95.65 
 
 		 125 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  76.61 
 
 		 125 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  72.58 
 
 		 181 aa  196  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  74.19 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  81.97 
 
 		 128 aa  190  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  72.88 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  72.03 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  36.89 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  37.29 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  31.62 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  27.88 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  27.88 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5286  molybdopterin oxidoreductase  23.93 
 
 		 992 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3526  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 		 992 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3248  hypothetical protein  28.33 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1325  hypothetical protein  23.28 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>