126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3984 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  99.12 
 
 		 342 aa  695    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  99.42 
 
 		 342 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  100 
 
 		 342 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  97.08 
 
 		 342 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  87.43 
 
 		 341 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  87.35 
 
 		 341 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  87.06 
 
 		 341 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  83.68 
 
 		 338 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  85.92 
 
 		 340 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  85.84 
 
 		 340 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34480  arginine N-succinyltransferase  74.56 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2053  arginine succinyltransferase  63.24 
 
 		 344 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  50.29 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  50 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  50.15 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  50.72 
 
 		 350 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  51.59 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  50.43 
 
 		 350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  50.89 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  51.16 
 
 		 344 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  50.15 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  50.15 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  50.15 
 
 		 344 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  49.85 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  49.85 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  50.15 
 
 		 344 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  49.41 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  45.72 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  45.13 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  44.54 
 
 		 339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0646  arginine N-succinyltransferase  45.13 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  44.25 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3879  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3753  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3696  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  43.52 
 
 		 348 aa  295  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  42.94 
 
 		 348 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  45.38 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  43.57 
 
 		 343 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0618  arginine N-succinyltransferase  43.95 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  43.57 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  43.57 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  45.13 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  43.66 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0994163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  43.66 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  43.66 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  46.2 
 
 		 361 aa  291  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  43.27 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  44.12 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  42.49 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  42.82 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  43.2 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  43.86 
 
 		 343 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  43.2 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  43.2 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  43.49 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  42.9 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.9 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.9 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.9 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  46.33 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  42.52 
 
 		 344 aa  278  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2734  arginine N-succinyltransferase  43.58 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002276  arginine N-succinyltransferase  43.36 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  44.06 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00078  arginine N-succinyltransferase  44.54 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0164  arginine N-succinyltransferase  41.62 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.468749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  41.96 
 
 		 339 aa  272  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  42.9 
 
 		 337 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  42.14 
 
 		 343 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  41.94 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1785  arginine N-succinyltransferase  41.72 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  40.12 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  39.82 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2890  arginine N-succinyltransferase  39.42 
 
 		 366 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  36.9 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  36.9 
 
 		 338 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2054  arginine succinyltransferase  37.87 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  39.88 
 
 		 354 aa  225  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  35.91 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  35.91 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  35.61 
 
 		 339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  35.91 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  38.99 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  39.41 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  36.61 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  36.66 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  35.21 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  36.66 
 
 		 343 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1857  arginine succinyltransferase  37.24 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0210097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4284  arginine succinyltransferase  36.2 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  38.86 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>