23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2011 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  89.37 
 
 		 254 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  88.58 
 
 		 293 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  53.31 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  55.25 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  56.92 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  42.23 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  33.6 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  36.65 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  31.53 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  33.77 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  32.19 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  25.97 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  30.24 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  27.27 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5347  hypothetical protein  29.91 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  34.85 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  34.85 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  34.85 
 
 		 273 aa  42  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>