24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0814 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0814  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0775  hypothetical protein  94.74 
 
 		 100 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0881  hypothetical protein  78.46 
 
 		 71 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999097  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3643  hypothetical protein  59.3 
 
 		 94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0800  hypothetical protein  94.44 
 
 		 54 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1008  hypothetical protein  70.15 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1170  hypothetical protein  67.16 
 
 		 75 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53450  hypothetical protein  65.08 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00993995  normal  0.0130704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1022  hypothetical protein  58.62 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0952  hypothetical protein  58.62 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.938842  normal  0.0299289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1073  hypothetical protein  56.9 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1261  hypothetical protein  52.54 
 
 		 71 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0887  hypothetical protein  56.9 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1912  pressure-regulated protein  52.31 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.348947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1061  hypothetical protein  58.18 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3496  hypothetical protein  52.73 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1765  hypothetical protein  50.85 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0504773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0070  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1121  hypothetical protein  51.67 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0335  hypothetical protein  49.15 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0704  hypothetical protein  47.46 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1721  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2694  hypothetical protein  48.21 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  49.12 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>