13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3422 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3422  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 713 aa  1451    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3308  Tetratricopeptide domain protein  49.92 
 
 		 714 aa  650    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3116  tetratricopeptide TPR_4  43.55 
 
 		 700 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4217  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 		 684 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0406  TPR domain-containing protein  40.92 
 
 		 748 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.754061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3842  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 702 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3926  Tetratricopeptide TPR_4  32.43 
 
 		 694 aa  320  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0916918 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0652  hypothetical protein  22.65 
 
 		 833 aa  54.3  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1196  hypothetical protein  21.66 
 
 		 837 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.500678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  32.63 
 
 		 243 aa  50.8  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 243 aa  50.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 		 253 aa  47.8  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2048  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 253 aa  43.9  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>