13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2712 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2995  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.15 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2429  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.01 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0188402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2621  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  29.66 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.25 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1592  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.81 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1740  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.48 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000969035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3797  anti-sigma-factor antagonist  38.67 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.1 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1605  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  26.6 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  39.22 
 
 		 588 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>