22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2566 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2566  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0176  hypothetical protein  67.95 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0234  hypothetical protein  65.38 
 
 
84 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1870  hypothetical protein  44.05 
 
 
85 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000823152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2786  hypothetical protein  51.81 
 
 
91 aa  84.3  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.758487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0631  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4810  hypothetical protein  48.78 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0802082  hitchhiker  0.00240732 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3462  hypothetical protein  48.15 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.438272 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4381  hypothetical protein  45.12 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.735891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7138  hypothetical protein  42.17 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1936  hypothetical protein  40.48 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2212  hypothetical protein  39.29 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1827  hypothetical protein  39.51 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5414  hypothetical protein  41.25 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0032  hypothetical protein  39.29 
 
 
86 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7049  hypothetical protein  38.1 
 
 
86 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0979561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6355  hypothetical protein  37.97 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2294  hypothetical protein  29.21 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00328626  hitchhiker  0.00199724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4119  hypothetical protein  38.1 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2046  hypothetical protein  27.06 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343209  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2349  hypothetical protein  31.03 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000863109  normal  0.0220704 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4320  hypothetical protein  37.68 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>