14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1722 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1722  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2893  hypothetical protein  52.73 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000100997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4341  hypothetical protein  41.44 
 
 
115 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2402  hypothetical protein  47.32 
 
 
116 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000157501  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1167  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1364  hypothetical protein  35.64 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2920  hypothetical protein  36.63 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2513  hypothetical protein  41.74 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00274394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1706  hypothetical protein  42.61 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0633e-25 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0532  hypothetical protein  37.37 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094496  unclonable  0.000000000020236 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0362  hypothetical protein  37.37 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03405  hypothetical protein  31.73 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1885  hypothetical protein  32.05 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0879  hypothetical protein  35.44 
 
 
204 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.765052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>