22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0894 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  83.33 
 
 
90 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  74.44 
 
 
90 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  75.56 
 
 
90 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  70 
 
 
90 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  68.89 
 
 
90 aa  140  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  63.33 
 
 
91 aa  134  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  66.67 
 
 
91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  63.33 
 
 
92 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  60 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  50.56 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  48.31 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  44.44 
 
 
95 aa  91.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  31.11 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  28.09 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  29.21 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  30.68 
 
 
91 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  32.81 
 
 
106 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  31.03 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7096  hypothetical protein  27.06 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>