25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0591 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0591  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  100 
 
 
110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3528  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  62.73 
 
 
110 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1134  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  38.46 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0381  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  29.59 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000428364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0938  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  37.14 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103381  normal  0.508582 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0507  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  25.93 
 
 
119 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105387  hitchhiker  0.0000332373 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0670  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  28.7 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1630  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  60 
 
 
97 aa  47  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.216778  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01741  NADH dehydrogenase subunit K  31.31 
 
 
107 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.359361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1346  NADH dehydrogenase subunit K  29.29 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.948415  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1524  NADH dehydrogenase subunit K  26.26 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02301  NADH dehydrogenase subunit K  26.26 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0649  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  38.2 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.513085  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0469  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  29.41 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0283  NADH dehydrogenase subunit K  28.42 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0322  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 4L  30.11 
 
 
113 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01861  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
106 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26871  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
109 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0159  NADH dehydrogenase subunit K  27.55 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2409  NADH dehydrogenase subunit K  28.42 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0556  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  26.47 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2869  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  30.53 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.680399  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01751  NADH dehydrogenase subunit K  26.53 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0206  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 4L  32.04 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.370737  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5943  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L  27.45 
 
 
114 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>