14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0363 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0363  hypothetical protein  100 
 
 
1266 aa  2487    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2997  hypothetical protein  45.93 
 
 
1877 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0670  hypothetical protein  46.99 
 
 
1248 aa  152  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.576207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5242  hypothetical protein  41.98 
 
 
596 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000221753  hitchhiker  0.0000000135366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3933  hypothetical protein  39.16 
 
 
842 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95807  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0664  hypothetical protein  39.02 
 
 
480 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411702  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1672  hypothetical protein  37.78 
 
 
472 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3940  hypothetical protein  33.73 
 
 
178 aa  118  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2556  hypothetical protein  34.39 
 
 
475 aa  116  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1048  hypothetical protein  37.74 
 
 
512 aa  112  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3161  hypothetical protein  32.02 
 
 
582 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3603  hypothetical protein  41.67 
 
 
496 aa  99  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000547172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2456  hypothetical protein  36.14 
 
 
1444 aa  96.3  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0154733  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1806  hypothetical protein  22.39 
 
 
1561 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>