13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2775 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  826    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  66.67 
 
 		 411 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  57.86 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  57.46 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  52.53 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  52.39 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  51.52 
 
 		 408 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  45.83 
 
 		 411 aa  384  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  27.44 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  26.76 
 
 		 238 aa  90.1  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  34.74 
 
 		 557 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  36.14 
 
 		 544 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  36.14 
 
 		 542 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>