16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1990 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  728    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0449  hypothetical protein  72.22 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  23.42 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  24.07 
 
 		 405 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  20.56 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  22.59 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  22.69 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  24.42 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  22.74 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  22.12 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  22.22 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  21.15 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  18.7 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  18.61 
 
 		 398 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  18.71 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  22 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>