11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0775 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0775  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1697  hypothetical protein  61.9 
 
 
50 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0991  hypothetical protein  52.38 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1531  hypothetical protein  47.73 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.707315  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1500  hypothetical protein  51.06 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0918  hypothetical protein  51.22 
 
 
116 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1106  hypothetical protein  51.43 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1271  hypothetical protein  53.85 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.135008  normal  0.0172039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1581  hypothetical protein  48.72 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1450  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.330959  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1185  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000250834  normal  0.746825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>