14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0236 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  320  7e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  63.12 
 
 		 277 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  57.45 
 
 		 277 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  51.27 
 
 		 175 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  60.99 
 
 		 277 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  51.09 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  48 
 
 		 273 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  52.63 
 
 		 280 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  33.57 
 
 		 212 aa  86.3  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  39.84 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  29.93 
 
 		 323 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>