95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1424 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1424  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.902864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0528  protein of unknown function UPF0125  73.27 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1859  hypothetical protein  32.32 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1367  protein of unknown function UPF0125  34.04 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1458  hypothetical protein  36.08 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1303  protein of unknown function UPF0125  34.04 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2818  electron transport complex, H subunit  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0412  hypothetical protein  42.19 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2051  TGS domain-containing protein  38.24 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1279  hypothetical protein  32.63 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.637048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2030  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0436  hypothetical protein  40.62 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1899  hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2901  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.471326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3013  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2881  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2831  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0253438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2899  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3007  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0051008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2776  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2902  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288774  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2017  hypothetical protein  32.32 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1066  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166037  normal  0.551633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1057  protein of unknown function UPF0125  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02506  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02470  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0961  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2464  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2770  hypothetical protein  30.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0970822  normal  0.121227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1530  TGS domain-containing protein  41.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.606843  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1754  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.592025  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2557  TGS domain-containing protein  41.46 
 
 		 269 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1196  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1301  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2410  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334233  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3282  TGS domain-containing protein  41.46 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2030  TGS domain-containing protein  41.46 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2995  protein of unknown function UPF0125  39.39 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0506  hypothetical protein  34.44 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2759  protein of unknown function UPF0125  30.84 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3858  hypothetical protein  29.63 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00445211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6080  hypothetical protein  31.31 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1997  hypothetical protein  31.31 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1390  hypothetical cytosolic protein  31.25 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000367615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0376  hypothetical protein  33.77 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84295  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1483  hypothetical protein  40.35 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.982053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004298  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1704  hypothetical protein  34.02 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0726  hypothetical protein  30 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.371897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1316  hypothetical protein  29.47 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0406847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01126  hypothetical protein  43.18 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.355992  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5307  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.638439  normal  0.130756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2625  protein of unknown function UPF0125  32.86 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2433  protein of unknown function UPF0125  43.18 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.466007  normal  0.136012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2340  hypothetical protein  33.68 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.948385  normal  0.128929 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1518  hypothetical protein  52.63 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2052  protein of unknown function UPF0125  45.24 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1452  hypothetical protein  30 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1096  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1426  hypothetical protein  32.94 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.016037  hitchhiker  0.00803387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2003  hypothetical protein  34.52 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1336  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1907  hypothetical protein  35.53 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2950  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1241  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2852  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2774  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0594295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1309  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1231  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1300  hypothetical protein  44.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.942467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1461  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245289  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3050  protein of unknown function UPF0125  44.19 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.342332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2059  hypothetical protein  47.22 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1475  hypothetical protein  44.19 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1143  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.31173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2738  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000183401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3006  hypothetical protein  34.12 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0965  protein of unknown function UPF0125  27.66 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0567  hypothetical protein  36.54 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.179466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3300  protein of unknown function UPF0125  37.21 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.409729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3688  hypothetical protein  28.21 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.01115  normal  0.0970123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1592  hypothetical protein  40.3 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1741  hypothetical protein  30.86 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180129  normal  0.0331818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2891  hypothetical protein  31.82 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000110176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1284  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.151489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2477  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0203435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2550  hypothetical protein  31.78 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1522  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.43135  hitchhiker  0.00455736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3220  protein of unknown function UPF0125  28.4 
 
 		 97 aa  40  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01179  hypothetical protein  36.49 
 
 		 91 aa  40  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0261135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>