11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3462 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3462  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  938    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382802  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1305  transposon transposase  71.37 
 
 
464 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1269  transposase IS605 OrfB  30.75 
 
 
494 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1117  transposase IS605 OrfB  29.73 
 
 
441 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000234491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0745  transposase IS605 OrfB  30.2 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00432126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0271  transposase IS605 OrfB  29.73 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000409425  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  28 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  28 
 
 
401 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  27.73 
 
 
375 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  27.67 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2486  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  24.12 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>