30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4254 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  77.38 
 
 		 84 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  67.47 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  65.85 
 
 		 86 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  65.85 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  67.07 
 
 		 86 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  65.06 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  64.29 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  63.86 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  62.65 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  62.65 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  32.79 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  26.67 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  26.39 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  27.4 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  24.69 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  27.38 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1909  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00135676  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2240  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.575696  normal  0.0472844 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3697  hypothetical protein  30.65 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2020  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3669  hypothetical protein  30.65 
 
 		 83 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3647  hypothetical protein  30.65 
 
 		 83 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3388  hypothetical protein  30.65 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.032209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3427  hypothetical protein  30.65 
 
 		 82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3322  hypothetical protein  27.4 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  35.19 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1573  hypothetical protein  29.51 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330992  normal  0.269924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>