11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3859 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3859  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  278  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06690  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4464  putative lipoprotein  42.07 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0688  lipoprotein, putative  48.62 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5021  hypothetical protein  47.75 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0547  hypothetical protein  44.26 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0565  hypothetical protein  44.3 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0558  hypothetical protein  44.72 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0512  hypothetical protein  45.37 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_11370  putative lipoprotein  43.96 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0255476  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1043  putative lipoprotein  43.96 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
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