122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3629 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3629  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43030  hypothetical protein  77.78 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63040  hypothetical protein  72.16 
 
 		 101 aa  140  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5486  hypothetical protein  75.58 
 
 		 100 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4512  hypothetical protein  59.79 
 
 		 104 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.593849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0758  hypothetical protein  61.36 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1270  hypothetical protein  54.64 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.417664  normal  0.206027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2738  hypothetical protein  50.5 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000183401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4200  hypothetical protein  54.55 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1284  hypothetical protein  56.67 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.151489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3969  hypothetical protein  53.93 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.427606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1409  hypothetical protein  52.58 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1522  hypothetical protein  52.58 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.43135  hitchhiker  0.00455736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3827  hypothetical protein  48.45 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0965  protein of unknown function UPF0125  52.04 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2052  protein of unknown function UPF0125  53.68 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1374  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180129  normal  0.0331818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2978  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1741  hypothetical protein  49.02 
 
 		 108 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2891  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000110176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2774  hypothetical protein  47.92 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0594295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2852  hypothetical protein  47.92 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2950  hypothetical protein  47.92 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2386  hypothetical protein  48.96 
 
 		 112 aa  89.4  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1241  hypothetical protein  52.22 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2030  hypothetical protein  51.02 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1899  hypothetical protein  51.02 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1096  hypothetical protein  50.55 
 
 		 111 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2340  hypothetical protein  47.42 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.948385  normal  0.128929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1309  hypothetical protein  47.92 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1300  hypothetical protein  47.92 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.942467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1336  hypothetical protein  47.92 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01811  hypothetical protein  47.06 
 
 		 115 aa  87.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000710892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6080  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1997  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1604  hypothetical protein  50.54 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.541061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1475  hypothetical protein  46.88 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3050  protein of unknown function UPF0125  47.42 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.342332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2017  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3367  hypothetical protein  48.86 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0287345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1201  hypothetical protein  51.65 
 
 		 96 aa  84.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1231  hypothetical protein  46.88 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2433  protein of unknown function UPF0125  45.54 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.466007  normal  0.136012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5307  hypothetical protein  48.91 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.638439  normal  0.130756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3220  protein of unknown function UPF0125  46.81 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0376  hypothetical protein  47.42 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84295  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1196  hypothetical protein  47.83 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1143  hypothetical protein  51.11 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.31173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3099  hypothetical protein  45.83 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3300  protein of unknown function UPF0125  45.26 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.409729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3688  hypothetical protein  46.74 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.01115  normal  0.0970123 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0961  hypothetical protein  43.62 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1754  hypothetical protein  46.94 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.592025  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1279  hypothetical protein  48.91 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.637048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2051  TGS domain-containing protein  45.83 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1528  protein of unknown function UPF0125  45.92 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0726  hypothetical protein  42.55 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.371897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02506  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1057  protein of unknown function UPF0125  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1530  TGS domain-containing protein  44.79 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.606843  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1704  hypothetical protein  44.9 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2030  TGS domain-containing protein  44.79 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02470  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3282  TGS domain-containing protein  44.79 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2410  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2464  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1301  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2776  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2902  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1066  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166037  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2770  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0970822  normal  0.121227 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3007  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0051008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2818  electron transport complex, H subunit  47.13 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3858  hypothetical protein  46.81 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00445211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3098  hypothetical protein  47.25 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.355992  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1316  hypothetical protein  43.43 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0406847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1907  hypothetical protein  51.11 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004298  hypothetical protein  42.39 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2831  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0253438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2557  TGS domain-containing protein  44.79 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0506  hypothetical protein  43.68 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3013  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2899  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2901  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.471326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2881  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01126  hypothetical protein  40.86 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2625  protein of unknown function UPF0125  46.08 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0289  hypothetical protein  43.96 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.141988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2099  hypothetical protein  47.13 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1483  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.982053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1859  hypothetical protein  44.33 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2995  protein of unknown function UPF0125  42.57 
 
 		 104 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1407  hypothetical protein  45.98 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2477  hypothetical protein  40 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0203435  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1390  hypothetical cytosolic protein  41.49 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000367615  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3937  hypothetical protein  43.53 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1452  hypothetical protein  40.43 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151417  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3198  rnfH protein  43.53 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0689486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0436  hypothetical protein  39.33 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1496  hypothetical protein  39.76 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>