17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3220 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  729    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2991  hypothetical protein  63.39 
 
 		 343 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25392  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2701  hypothetical protein  67.89 
 
 		 308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5682  hypothetical protein  33 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6046  hypothetical protein  33 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6532  hypothetical protein  32.67 
 
 		 305 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  0.079973 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7477  hypothetical protein  33.55 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  34.11 
 
 		 304 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2823  hypothetical protein  29.93 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4673  hypothetical protein  28.47 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4720  hypothetical protein  26.26 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4632  hypothetical protein  26.26 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5528  hypothetical protein  32.53 
 
 		 100 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5014  hypothetical protein  25.7 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1868  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>