16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2156 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  65.38 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  66.47 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  66.46 
 
 		 340 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  64.58 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  65.54 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  64.29 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  62.12 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  63.03 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  62.24 
 
 		 342 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  63.5 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  52.45 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  47.94 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  28.45 
 
 		 130 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  34.78 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  24.74 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>