15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1928 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  56.57 
 
 		 99 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  57.14 
 
 		 99 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  51.02 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  48.98 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1705  type IV pilus assembly PilZ  47.96 
 
 		 99 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  47.96 
 
 		 99 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  47.96 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  38.55 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  33.68 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  34.02 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  32.98 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  31.71 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>