10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1777 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1777  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.909044  normal  0.825456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32920  hypothetical protein  64.48 
 
 		 413 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1393  hypothetical protein  62.25 
 
 		 409 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4116  hypothetical protein  56.31 
 
 		 402 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4586  hypothetical protein  56.45 
 
 		 402 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.795703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1302  hypothetical protein  58.06 
 
 		 402 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3896  hypothetical protein  56.38 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2660  ribosomal protein L31  40.93 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 695 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  25.4 
 
 		 689 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>